Já está comprovado que a microbiota intestinal está envolvida na etiologia e no desenvolvimento de várias enfermidades, incluindo as doenças hepáticas crônicas. No entanto, a caracterização integral multi-reino – bacterioma intestinal, micobioma e viroma – em pacientes com fibrose hepática crônica relacionada à hepatite B (CHB-LF), permanece obscura. Em busca de respostas, um estudo liderado por pesquisadores chineses analisou o microbioma intestinal de pacientes com CHB-LF em comparação a indivíduos saudáveis. Com base no sequenciamento de amostras fecais foram identificadas diferenças significativas na abundância de espécies bacterianas, fúngicas e virais entre os grupos analisados. Tais achados fornecem biomarcadores que auxiliarão futuros estudos de intervenção clínica.
Ao analisar as amostras, a pesquisa revelou que o bacterioma intestinal, o micobioma e o viroma de pacientes com CHB-LF foram fundamentalmente alterados. “Identificamos uma abundância de espécies. Caracterizadas por um painel de 110 espécies bacterianas diferencialmente abundantes, 16 espécies fúngicas diferenciais e 90 vírus diferenciais”, informam os autores. As bactérias enriquecidas com CHB-LF representativas incluíam membros de Blautia_A (anaeróbicas), as Gram-positivas Dorea, Streptococcus e Erysipelatoclostridium. Em contrapartida, algumas espécies de Bacteroides (como B. finegoldii e B. thetaiotaomicron), Faecalibacterium (principalmente F. prausnitzii) e Bacteroides_A foram esgotadas em pacientes.
Além disso, fungos como Malassezia spp., Candida spp. e Mucor circinelloides foram mais abundantes em indivíduos com CHB-LF, enquanto Mucor irregularis, Phialophora verrucosa, Hortaea werneckii e Aspergillus fumigatus estavam diminuídos. Em relação aos vírus enriquecidos com CHB-LF, os autores descrevem que 18 continham Siphoviridae, 12 tinham Myoviridae e 1 tinha Podoviridae. Já os vírus enriquecidos com controle incluíam 16 membros Siphoviridae, 9 Myoviridae, 2 Quimbyviridae e 1 Podoviridae_crAss-like.
Sequenciamento Shotgun
Para comparar e investigar a composição microbiana intestinal de 25 pacientes com CHB-LF e 28 controles saudáveis, a pesquisa reuniu um total de 349,8 Gbp de dados de alta qualidade (em média, 6,6 ± 1,3 Gbp por amostra). Com base no sequenciamento Shotgun (método usado para sequenciamento de fitas longas de DNA) de metagenoma completo das amostras fecais foram caracterizados sistematicamente o bacterioma intestinal, o micobioma e o viroma da CHB-LF. “Mapeamos as leituras metagenômicas no banco de dados e geramos um perfil de bacterioma intestinal de 5.125 táxons bacterianos e arqueanos, incluindo 24 filos, 39 classes, 77 ordens, 146 famílias, 512 gêneros e 4.327 espécies”, descrevem os autores.
O estudo revelou, ainda, que as assinaturas multi-reino intestinais (bacterioma intestinal, micobioma e viroma) associadas à CHB-LF estavam fortemente interconectadas. Esse achado sugere que podem atuar conjuntamente na doença. “Além disso, descobrimos que as assinaturas microbianas foram eficazes na discriminação de pacientes de controles saudáveis”, concluem os autores. Tais resultados propõem, portanto, o potencial da microbiota intestinal na predição de CHB-LF e doenças relacionadas. O artigo ‘Metagenome-based characterization of the gut bacteriome, mycobiome, and virome in patients with chronic hepatitis B-related liver fibrosis’ foi publicado, em outubro de 2024, na revista Frontiers.
